Mary Malone é uma cientista do mundo de Will que estuda as partículas de sombra. Ela conhece Lyra no ambiente de trabalho, onde ela (Lyra) lhe fala sobre o Pó e sobre o Aletiômetro. No livro é descrita tendo cabelos negros e olhos verdes, e ajuda Lyra e Will conforme a história se desenrola.
Mary Malone fora freira antes de ser cientista e fui uma brusca mudança em sua vida, isso aconteceu em Portugal, logo após um congresso ela viajou a uma praia com apenas um restaurante onde ela se aproximou muito de um outro homem, que a lembrou de quando era pequena e se apaixonou por um menino que teve que se mudar para longe.